PCR技术及其在食品微生物检测中的运用研究
2020-03-04 22:54:57 来源: 食品安全导刊
PCR技术及其在食品微生物检测中的运用研究
随着收入水平的提高,老百姓对食品的消费能力越来越强,为适应人们的消费需求,市场上的食品类型也日益多样化和个性化。在这一形势下,食品质量安全检测工作十分重要。近年来,食品安全检测技术手段不断涌现,给食品安全检测工作提供了更多选择。其中PCR技术因其准确性和高效性在众多技术手段中脱颖而出,成为越来越多食品检测机构和部门采用的一种技术方法。
PCR技术及其在食品微生物检测中的作用
PCR技术是一种基因技术全称是聚合酶链式反应技术,该技术通过体外模拟DNA的复制过程来获得目标DNA片段,从而对实验对象的基因特征进行分析和判定。在食品微生物检测工作中,利用PCR技术能够对食品检测样品中的微生物,哪怕是含量很少的微生物进行基因标记及基因复制,可以在很短的时间内检测较多的食品样品,而且检测自动化程度高,操作简便,因此该方法在食品微生物检测中的运用效率很高。
PCR技术在食品微生物检测中的应用方法
PCR技术在食品微生物检测中的应用十分广泛,比如对金黄色葡萄球菌的检测、对绿脓杆菌的检测、对大肠杆菌的检测、对沙门氏菌的检测等等,均表现出较好的检测效果。金黄色葡萄球菌容易在蔬菜、瓜果等食品中生存繁殖,代谢产物中存在SE类型的有害物质,这种物质对食用者极可能造成食物中毒,PCR技术可以对食品样品中的SE物质进行微量检测,可精确到1pg。绿脓杆菌代谢产物中含有毒素的特定基因可以被PCR技术中的特定蛋白有效标记,通过特定蛋白的检测间接获得绿脓杆菌的含量。采用同样的原理,PCR技术可以对食品中的大肠杆菌、沙门氏菌进行特定基因扩增、标记,准确高效地得到这些微生物在食品样品中的含量。
在实际应用中,PCR技术又可以分为以下几种测定方法。
常规PCR检测法:测定目标物质的DNA模板和与之相对应的引物进行混合,然后向混合物中加入一定量的聚合酶。在特定的温度和催化剂条件狭隘,聚合酶会促使目标物质的DNA模板序列扩增,经历DNA复制的多个周期后便得到DNA片段。这一DNA片段可以作为循环DNA模板继续进行复制扩增。在放大目标物质后,对待测目标物质特定DNA进行标记测定,间接得到待测物的微生物含量。
多重PCR检测法:该方法的原理是在常规PCR技术的基础上采用多个DNA引物,比如在同一个PCR反应体系里引入两个或两个以上的反应引物,在聚合酶的作用下,这些引物同时发生复制扩增,继而得到多个DNA片段。与常规PCR检测法不同的是,多重PCR检测法可以微生物的多个致病因子进行检测,而常规PCR检测法用于微生物单一致病因子的测定。该方法除了具有常规PCR检测法的高效性和准确性以外,还具有良好的系统性,能够对成组的微生物病原体或致病基因进行检测,因此是一种经济高效的食品微生物检测方法。
PR-PCR检测法:此种检测方法是PCR检测法的变形,其技术原理是将检测目标中的一条RNA先进行逆转录得到与之互补的DNA,然后以得到的DNA链为模板再通过常规PCA技术进行DNA的复制扩增。此种检测方法的技术关键在于RNA的逆转录环节,必须确保RNA模板为完整的而且不含有蛋白质、DNA等杂质的基因链。PR-PCR检测法可以作为微生物检测的定性分析,还可以用于微生物检测的定量分析,比如将荧光技术和数字技术与PCR技术相结合,可以对检测目标中的微生物进行定量,检测具有较好的灵敏性,检测结果更加精确。
上图为常见的食品微生物PCR检测方法的病毒基因图。图中,M列代表1000 bp DNA Marker;1列代表鼠伤寒沙门氏菌、金黄色葡萄糖球菌;2列代表鼠伤寒沙门氏菌、大肠杆菌O157:H7;3列代表鼠伤寒沙门氏菌、单核细胞性李斯特菌;4列代表金黄色葡萄球菌、大肠杆菌O157:H7;5列代表金黄色葡萄球菌、单核细胞性李斯特菌;6列代表大肠杆菌O157:H7、大肠杆菌O157:H7;8列代表鼠伤寒沙门菌、金黄色葡萄球菌、单核细胞性李斯特菌;9列代表金黄色葡萄球菌、大肠杆菌O157:H7、单核细胞性李斯特菌;10列代表鼠伤寒沙门氏菌、大肠杆菌O157:H7、单核细胞性李斯特菌;11列代表鼠伤寒沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、大肠杆菌O157:H7、单核细胞性李斯特菌;12列代表ddH2O。
PCR技术的发展方向
PCR技术在食品微生物检测中的应用越来越普遍,并发挥出越来越不容忽视的作用。未来,PCR技术的发展重点集中在三个方面。一方面,DNA或RNA模板的纯度要求越来越高。PCR技术检测结果的准确性在很大程度上取决于DNA或RNA模板的纯度,因此未来的研究工作会集中在DNA或RNA的提取方法研究上,以获得更高的提取效率和提取纯度。另一方面,PCR检测实验中出现的假阳性问题将进一步攻克。由于食品中的微生物种类多而且具有不稳定性,因此在PCR检测过程中会因为PCR技术方法的高灵敏度而出现一定的假阳性现象,在如何识别假阳性,如何避免假阳性问题上,未来将会有更多的方法,进一步提高PCR技术监测的准确性。第三方面,随着数据时代的到来,数据技术与PCR技术的结合也将更加紧密,演变为数字PCR技术。近几年,国内的数字PCR开发商已经有十几家,数字PCR技术的关键越来越侧重于芯片设计和制作,通过内置芯片实现微滴式可智能识别的质量控制目标,将自动化和智能化以数据的形势表达和呈现。芯片式数字PCR技术可以将微滴液体随机排布与芯片的阵列结构中,对于改善传统PCR技术中的热扩散造成的检测结果偏差十分有效。数字PCR技术突破了传统技术中检测结果受到标准溶液及标准曲线的限制,而且在高背景下也可以获得精准的检测结果,使基因定量检测结果的灵敏性和特异性大大提高,未来,数字PCR技术在食品微生物检测中应用前景良好。
食品的安全监管和食品质量问题是国家和社会民众十分关注的问题。近年来,食品市场中的质量问题事件仍有发生,不仅破坏了市场的健康有序发展,而且给消费者带来了更多的不确定和不信任因素,影响到社会稳定和谐。食品检验检测工作容不得丝毫懈怠。在食品微生物检测中,PCR技术凭借高灵敏度和高准确度从众多的检测技术中脱颖而出。未来,食品检测部门及从业人员应继续围绕实际,加大探索力度,推动该技术应用水平的不断提升,为食品安全监管工作提供强大的技术支持。
苗辉 林静
日照市市场监管检验检测中心